智能文档自定义设置比对规则的具体步骤可能因不同的智能文档系统和具体需求而有所差异。

明确比对需求：在开始设置比对规则之前，首先要明确比对的需求和目标。确定要比对的文档类型、格式和内容，以及期望的比对结果和精度。

选择合适的智能文档系统：根据比对需求，选择一个合适的智能文档系统。确保该系统具有自定义设置比对规则的功能，并能够满足您的比对需求。

了解系统功能和规则设置方式：在使用智能文档系统之前，先了解系统的基本功能和操作方式。查阅系统的用户手册或在线帮助文档，了解如何设置比对规则、定义比对条件、调整比对参数等。

定义比对规则：根据比对需求，定义相应的比对规则。这可能包括指定要比对的字段、设置字段的比对方式（如精确匹配、模糊匹配等）、定义特殊字符的处理方式等。确保规则的定义清晰、准确，并能够涵盖各种可能的比对情况。

调整比对参数：智能文档系统通常提供一些比对参数，用于调整比对的敏感度和准确性。根据实际需求，调整这些参数以获得最佳的比对效果。这可能包括调整相似度阈值、设置忽略大小写等。

测试和验证：在设置好比对规则后，进行测试和验证是非常重要的步骤。使用一些样本文档进行测试，检查比对结果是否符合预期，并对比对规则进行必要的调整和优化。确保系统的比对功能能够满足实际需求，并具有足够的准确性和可靠性。

持续优化和改进：随着业务的发展和需求的变化，可能需要对比对规则进行持续的优化和改进。定期评估比对效果，收集用户反馈，并根据实际情况调整比对规则或引入新的比对技术，以保持智能文档系统的先进性和实用性。

具体的操作步骤和设置方式可能因不同的智能文档系统而有所差异。建议参考所使用智能文档系统的官方文档或向系统提供商寻求支持，以获得更详细和准确的指导。