两份招标文件查重的方法主要有以下两种： 一、使用查重软件 准备文件：将所有的招标文件都以电子文档的形式整理好，通常为Word、PDF等格式。

选择软件：从市场上选择一款合适的查重软件，如实在智能IDP，能提供高效的查重服务，但具体功能和特点有所不同。

上传文档：使用查重软件将这些文档逐一导入系统进行比对。

大多数软件支持一键上传，操作便捷。

查看报告：软件会自动进行扫描和分析，然后生成相似度报告。

报告中会给出相似度百分比，这个百分比越高，说明两份文档之间的相似度越高。

判断与处理：根据报告中的结果，判断文档之间的相似性和重复程度。

当相似度超过一定阈值时，可以怀疑该文档存在抄袭或剽窃的可能，需要进一步核实和调查。

二、人工核对 仔细阅读：招标人应该仔细阅读每份招标文件，并对其中的关键信息进行记录。

对比分析：利用比较表格或者专门的软件工具，对不同的招标文件进行一一对比，查看其中的差异和相似之处。

判断与记录：根据对比结果，判断两份标书是否存在重复或相似的内容，并进行记录。

注意：虽然人工核对方法较为原始，但在某些情况下可能更为准确，特别是当涉及到复杂的文本结构或专业术语时。

然而，这种方法效率较低且易受主观因素影响。

综上所述，使用查重软件进行查重是更高效且准确的方法。

在选择具体工具时，应根据自身需求和行业特性进行挑选。

同时，也可以结合人工核对的方法进行辅助查重，以确保查重的准确性和全面性。